RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	DERA	Q9Y315	318 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOGA1	O94964	1423 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	AOX1	Q06278	1338 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHD4	Q14839	1912 aa		3.4	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	CUL7	Q14999	1698 aa		3.4	□□□□□ -1.86
NEDD4L-222	ENST00000588494	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC01548	A6NM66	108 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TISP43	B9A030	160 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRM8	O00222	908 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEPT4	O43236	478 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TK1	P04183	234 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PYGL	P06737	847 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP21A2	P08686	494 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPG	P29372	298 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXD12	P35452	270 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	YPEL5	P62699	121 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFF2	Q03403	129 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEC23B	Q15437	767 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD109	Q6YHK3	1445 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	UEVLD	Q8IX04	471 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAF1	Q8N7H5	531 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINS1	Q8NG48	757 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	HASPIN	Q8TF76	798 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASB12	Q8WXK4	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDB2	Q92466	427 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	STAM	Q92783	540 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TBATA	Q96M53	351 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCC8	Q09428	1581 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RRH	O14718	337 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	DSCR3	O14972	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	INPPL1	O15357	1258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPFIA2	O75334	1257 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PROP1	O75360	226 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTN5	O94779	1100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRKCG	P05129	697 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	POLB	P06746	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP3A4	P08684	503 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CKMT1A	P12532	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYL1	P12980	280 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	IDUA	P35475	653 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PROK1	P58294	105 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	B4GALNT1	Q00973	533 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDK18	Q07002	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	KAT2B	Q92831	832 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87

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