RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588278.1

TPGS1-202, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Gene TPGS1, Length 2,873 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-202ENST00000588278 NLRP7Q8WX94 980 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 FAM167AQ96KS9 214 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MARK4Q96L34 752 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 INSRRP14616 1297 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 EPHA3P29320 983 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MLH1P40692 756 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 AP3M2P53677 418 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ARL10Q8N8L6 244 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CDRT15Q96T59 188 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 EBF1Q9UH73 591 aa15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MED7O43513 233 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 COX4I1P13073 169 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MTTPP55157 894 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 CD300CQ08708 224 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MTA1Q13330 715 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 FLOT2Q14254 428 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MBLAC2Q68D91 279 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 HACE1Q8IYU2 909 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TNS4Q8IZW8 715 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 HPDLQ96IR7 371 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 RRN3Q9NYV6 651 aa15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 P4HA1P13674 534 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 L1CAMP32004 1257 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 XIAPP98170 497 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 APOFQ13790 326 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TBCCQ15814 346 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 POTEHQ6S545 545 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 LZICQ8WZA0 190 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SLC35B4Q969S0 331 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 EMCNQ9ULC0 261 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 KCNN4O15554 427 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 KLHL2O95198 593 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TGFB3P10600 412 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 CYP2C8P10632 490 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 NDST1P52848 882 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 PPP2R5DQ14738 602 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 LRRC38Q5VT99 294 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MAPK15Q8TD08 544 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 PEBP4Q96S96 227 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 Q9H521 79 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 EVPLQ92817 2033 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ARID2Q68CP9 1835 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 NDST2P52849 883 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SLC5A3P53794 718 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 NR1H2P55055 460 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 KCNJ11Q14654 390 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 BBS12Q6ZW61 710 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SORT1Q99523 831 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SELENONQ9NZV5 590 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 HES2Q9Y543 173 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 HCRTO43612 131 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 CD97P48960 835 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MAPK10P53779 464 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ENPEPQ07075 957 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ADGRE1Q14246 886 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 AHI1Q8N157 1196 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 OR52B2Q96RD2 323 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.94■□□□□ 0.14
TPGS1-202ENST00000588278 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms