RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	5e-6	■■■■■ 52.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GYG2	O15488	501 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYL3	P08590	195 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PGAM1	P18669	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TKTL1	P51854	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC6	Q16204	474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	HAS3	O00219	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PTGES	O14684	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	BIRC5	O15392	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIT	P10721	976 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRPAP1	P30533	357 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IRX4	P78413	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	9e-6	■■■□□ 15.9
CSNK1D-222	ENST00000584377	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CAPN9	O14815	690 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	BEX3	Q00994	111 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DPYS	Q14117	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DBN1	Q16643	649 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GSC2	O15499	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CPT1A	P50416	773 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCNK1	O00180	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	GABRD	O14764	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TPP1	O14773	563 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NRP1	O14786	923 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP6V1G1	O75348	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	AQP5	P55064	265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	STX3	Q13277	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	NCSTN	Q92542	709 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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