RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RAD18Q9NS91 495 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 APOC2P02655 101 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2A7P20853 494 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 POMCP01189 267 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A087X1B8 175 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0U1RQJ8 604 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 H3BRB1 525 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 HOXA2O43364 376 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 PROCP04070 461 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ALOX12P18054 663 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 KCNK18Q7Z418 384 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 GSSP48637 474 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 COX10Q12887 443 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PHKG1Q16816 387 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.73■■□□□ 1.07
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