RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256		I6L893	689 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GGCX	P38435	758 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CDH4	P55283	916 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ST8SIA6	P61647	398 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CDO1	Q16878	200 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	WDR59	Q6PJI9	974 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	C14orf80	Q86SX3	495 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KDM1B	Q8NB78	822 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RLN3	Q8WXF3	142 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FBRS	Q9HAH7	460 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SUN2	Q9UH99	717 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	THADA	Q6YHU6	1953 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	EPN2	O95208	641 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SKIL	P12757	684 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RRM1	P23921	792 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SULT2A1	Q06520	285 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PMS2CL	Q68D20	193 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	VPS36	Q86VN1	386 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MCEE	Q96PE7	176 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FRYL	O94915	3013 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DRGX	A6NNA5	263 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256		E9PAM4	449 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	18.15	■□□□□ 0.5	2e-9	■■■□□ 18.6
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K13	O43283	966 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GYPC	P04921	128 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SERPING1	P05155	500 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-E	P13747	358 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DES	P17661	470 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	BCKDHB	P21953	392 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IRAK1	P51617	712 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PLK1	P53350	603 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ECT2L	Q008S8	904 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SPEM2	Q0P670	501 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	APCDD1	Q8J025	514 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RNF214	Q8ND24	703 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	OR2T3	Q8NH03	318 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PARVA	Q9NVD7	372 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	USP18	Q9UMW8	372 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		18.15	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	RTN2	O75298	545 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	ADRA1B	P35368	520 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	HDAC4	P56524	1084 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM14	Q14142	442 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM11	Q96F44	468 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MYO19	Q96H55	970 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	CNPY3	Q9BT09	278 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		18.13	■□□□□ 0.49

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