RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.43■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 GAREM1Q9H706 876 aa22.43■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.43■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TTC34A8MYJ7 566 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PDGFRAP16234 1089 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 MATKP42679 507 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 OXCT1P55809 520 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 MTA1Q13330 715 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SLC12A1Q13621 1099 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 KCNJ12Q14500 433 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 BIRC7Q96CA5 298 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.42■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 A0A1B0GVM2 712 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 A0A1B0GVT2 93 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 M0QYT0 321 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 DAB1O75553 588 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 GJB3O75712 270 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 KRT37O76014 449 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 C7P10643 843 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 NOS2P35228 1153 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SULT2A1Q06520 285 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 CST6Q15828 149 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 FBXL22Q6P050 247 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 USP30Q70CQ3 517 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 NAXDQ8IW45 347 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 OMDQ99983 421 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.41■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 MID1O15344 667 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 FAM193AP78312 1265 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ARID5BQ14865 1188 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 HLA-BQ31612 363 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SIK2Q9H0K1 926 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 IL21RQ9HBE5 538 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 WASF3Q9UPY6 502 aa22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CIPC-208ENST00000557115 A0A1W2PP55 124 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 TRIM16O95361 564 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 C1QTNF9P0C862 333 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 CYP11B1P15538 503 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 CD27P26842 260 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 SLC8A1P32418 973 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 PSMD8P48556 350 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 CENPCQ03188 943 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 TAF3Q5VWG9 929 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 STK40Q8N2I9 435 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 WDCPQ9H6R7 721 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 RRN3Q9NYV6 651 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 CHD8Q9HCK8 2581 aa22.39■■□□□ 1.17
CIPC-208ENST00000557115 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms