RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ASB2Q96Q27 587 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FNIP2Q9P278 1114 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ATP8B1O43520 1251 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CD101Q93033 1021 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRJQ12913 1337 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM114B3SHH9 223 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FSBPO95073 299 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ADH1BP00325 375 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HSD17B2P37059 387 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA1Q09470 495 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP4Q13115 394 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SHC4Q6S5L8 630 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB106AQ8N104 65 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 VPS45Q9NRW7 570 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SNTNA6NMZ2 147 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 F8VP50 259 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 AP5Z1O43299 807 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FGFR1P11362 822 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CDH4P55283 916 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SKOR1P84550 965 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CENPPQ6IPU0 288 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SCLYQ96I15 445 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SERAC1Q96JX3 654 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 AGAP3Q96P47 875 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINB12Q96P63 405 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CACNA1FO60840 1977 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ALS2Q96Q42 1657 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DPA1P20036 260 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RXRGP48443 463 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DDIASQ8IXT1 998 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLC35F6Q8N357 371 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC138Q96M89 665 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEH1Q9H213 219 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SGTAO43765 313 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ITGAVP06756 1048 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GUCY2FP51841 1108 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PNLIPRP1P54315 467 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GALCP54803 685 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLC38A3Q99624 504 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SH3GL1Q99961 368 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms