RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547216.1

ARHGAP9-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, human

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 587 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP9-208	ENST00000547216		M0R296	226 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MCF2L	O15068	1137 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GREM1	O60565	184 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CLDN11	O75508	207 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ADH1C	P00326	375 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CTAGE8	P0CG41	777 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ERCC2	P18074	760 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MX2	P20592	715 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	COL9A1	P20849	921 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC6A4	P31645	630 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	VIPR2	P41587	438 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CDH4	P55283	916 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZXDB	P98169	803 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CDH18	Q13634	790 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LLGL1	Q15334	1064 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WBP2	Q969T9	261 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HAUS1	Q96CS2	278 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TECTA	O75443	2155 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DRGX	A6NNA5	263 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DCLK1	O15075	740 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NCAM2	O15394	837 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TSPAN3	O60637	253 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TBL1X	O60907	577 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ECI2	O75521	394 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AMPD1	P23109	780 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IL4R	P24394	825 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR1E1	P30953	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ETFB	P38117	255 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OXCT1	P55809	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C5orf22	Q49AR2	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MPP7	Q5T2T1	576 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C14orf80	Q86SX3	495 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CPA6	Q8N4T0	437 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IGSF8	Q969P0	613 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KXD1	Q9BQD3	176 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MPP6	Q9NZW5	540 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NEU3	Q9UQ49	428 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216		H0Y626	953 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MFSD11	O43934	449 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RAMP2	O60895	175 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PHF2	O75151	1096 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RHOC	P08134	193 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PSMC3	P17980	439 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FCAR	P24071	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHRNA3	P32297	505 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NDST2	P52849	883 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LMNB2	Q03252	620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NR1H3	Q13133	447 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TDG	Q13569	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PDK1	Q15118	436 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANO4	Q32M45	955 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PARP15	Q460N3	678 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms