RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541960.5

GABARAPL1-210, Transcript of GABA type A receptor associated protein like 1, humanhuman

TSL 3

Gene GABARAPL1, Length 3,214 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1-210ENST00000541960 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.1■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 GIPC2Q8TF65 315 aa18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 H7C4K7 107 aa18.09■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 SPATA17Q96L03 361 aa18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.09■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 UGT1A9O60656 530 aa18.09■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 MLNP12872 115 aa18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 ITGB8P26012 769 aa18.09■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.09■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 DFFAO00273 331 aa18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 KRT4P19013 534 aa18.08■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 TBX4P57082 545 aa18.08■□□□□ 0.49
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GABARAPL1-210ENST00000541960 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 MGAT1P26572 445 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 CNTD1Q8N815 330 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 CKAP2Q8WWK9 683 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 ZNF333Q96JL9 665 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 SMC6Q96SB8 1091 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.08■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 EBAG9O00559 213 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 USP12O75317 370 aa18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 C2CD2LO14523 706 aa18.07■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.06■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 AP2A1O95782 977 aa18.06■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 SMARCB1Q12824 385 aa18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 USP41Q3LFD5 358 aa18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.06■□□□□ 0.48
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GABARAPL1-210ENST00000541960 STEAP4Q687X5 459 aa18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL1-210ENST00000541960 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.06■□□□□ 0.48
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