RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541960.5

GABARAPL1-210, Transcript of GABA type A receptor associated protein like 1, humanhuman

TSL 3

Gene GABARAPL1, Length 3,214 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1-210ENST00000541960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.24■■■■□ 3.87
GABARAPL1-210ENST00000541960 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.93■■■■□ 3.02
GABARAPL1-210ENST00000541960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
GABARAPL1-210ENST00000541960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.45■■■□□ 2.79
GABARAPL1-210ENST00000541960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.41■■■□□ 2.78
GABARAPL1-210ENST00000541960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.34■■■□□ 2.77
GABARAPL1-210ENST00000541960 ABCC9O60706 1549 aa31.97■■■□□ 2.71
GABARAPL1-210ENST00000541960 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.79■■■□□ 2.68
GABARAPL1-210ENST00000541960 NACADO15069 1562 aa31.54■■■□□ 2.64
GABARAPL1-210ENST00000541960 SCRIBQ14160 1630 aa31.43■■■□□ 2.62
GABARAPL1-210ENST00000541960 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
GABARAPL1-210ENST00000541960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.19■■■□□ 2.58
GABARAPL1-210ENST00000541960 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.69■■■□□ 2.5
GABARAPL1-210ENST00000541960 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.58■■■□□ 2.49
GABARAPL1-210ENST00000541960 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.41■■■□□ 2.46
GABARAPL1-210ENST00000541960 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.38■■■□□ 2.45
GABARAPL1-210ENST00000541960 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
GABARAPL1-210ENST00000541960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
GABARAPL1-210ENST00000541960 WIZO95785 1651 aa30.18■■■□□ 2.42
GABARAPL1-210ENST00000541960 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.17■■■□□ 2.42
GABARAPL1-210ENST00000541960 SMARCA4P51532 1647 aa30.09■■■□□ 2.41
GABARAPL1-210ENST00000541960 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
GABARAPL1-210ENST00000541960 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.66■■■□□ 2.34
GABARAPL1-210ENST00000541960 SMARCA2P51531 1590 aa29.56■■■□□ 2.32
GABARAPL1-210ENST00000541960 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.56■■■□□ 2.32
GABARAPL1-210ENST00000541960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.53■■■□□ 2.32
GABARAPL1-210ENST00000541960 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GABARAPL1-210ENST00000541960 TRIM41Q8WV44 630 aa29.36■■■□□ 2.29
GABARAPL1-210ENST00000541960 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
GABARAPL1-210ENST00000541960 NCAPD3P42695 1498 aa29.16■■■□□ 2.26
GABARAPL1-210ENST00000541960 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.13■■■□□ 2.25
GABARAPL1-210ENST00000541960 HMGXB3Q12766 1538 aa29.12■■■□□ 2.25
GABARAPL1-210ENST00000541960 ABCC8Q09428 1581 aa29.11■■■□□ 2.25
GABARAPL1-210ENST00000541960 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GABARAPL1-210ENST00000541960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.89■■■□□ 2.22
GABARAPL1-210ENST00000541960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
GABARAPL1-210ENST00000541960 SYNJ1O43426 1573 aa28.71■■■□□ 2.19
GABARAPL1-210ENST00000541960 CFTRP13569 1480 aa28.64■■■□□ 2.18
GABARAPL1-210ENST00000541960 SOGA1O94964 1423 aa28.64■■■□□ 2.18
GABARAPL1-210ENST00000541960 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.63■■■□□ 2.17
GABARAPL1-210ENST00000541960 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.55■■■□□ 2.16
GABARAPL1-210ENST00000541960 TOP2BQ02880 1626 aa28.49■■■□□ 2.15
GABARAPL1-210ENST00000541960 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.47■■■□□ 2.15
GABARAPL1-210ENST00000541960 EEA1Q15075 1411 aa28.44■■■□□ 2.14
GABARAPL1-210ENST00000541960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.43■■■□□ 2.14
GABARAPL1-210ENST00000541960 PRDM2Q13029 1718 aa28.42■■■□□ 2.14
GABARAPL1-210ENST00000541960 CUX1P39880 1505 aa28.39■■■□□ 2.14
GABARAPL1-210ENST00000541960 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.38■■■□□ 2.13
GABARAPL1-210ENST00000541960 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.29■■■□□ 2.12
GABARAPL1-210ENST00000541960 NESP48681 1621 aa28.22■■■□□ 2.11
GABARAPL1-210ENST00000541960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.17■■■□□ 2.1
GABARAPL1-210ENST00000541960 GOLGA3Q08378 1498 aa28.15■■■□□ 2.1
GABARAPL1-210ENST00000541960 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.14■■■□□ 2.1
GABARAPL1-210ENST00000541960 KIF21BO75037 1637 aa28.12■■■□□ 2.09
GABARAPL1-210ENST00000541960 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.12■■■□□ 2.09
GABARAPL1-210ENST00000541960 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.1■■■□□ 2.09
GABARAPL1-210ENST00000541960 CEP162Q5TB80 1403 aa28.07■■■□□ 2.08
GABARAPL1-210ENST00000541960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.07■■■□□ 2.08
GABARAPL1-210ENST00000541960 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GABARAPL1-210ENST00000541960 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.02■■■□□ 2.08
GABARAPL1-210ENST00000541960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28■■■□□ 2.07
GABARAPL1-210ENST00000541960 KIF27Q86VH2 1401 aa27.98■■■□□ 2.07
GABARAPL1-210ENST00000541960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.94■■■□□ 2.06
GABARAPL1-210ENST00000541960 PRXQ9BXM0 1461 aa27.93■■■□□ 2.06
GABARAPL1-210ENST00000541960 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
GABARAPL1-210ENST00000541960 TOPBP1Q92547 1522 aa27.91■■■□□ 2.06
GABARAPL1-210ENST00000541960 CUX2O14529 1486 aa27.89■■■□□ 2.06
GABARAPL1-210ENST00000541960 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.85■■■□□ 2.05
GABARAPL1-210ENST00000541960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.85■■■□□ 2.05
GABARAPL1-210ENST00000541960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GABARAPL1-210ENST00000541960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GABARAPL1-210ENST00000541960 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.8■■■□□ 2.04
GABARAPL1-210ENST00000541960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.8■■■□□ 2.04
GABARAPL1-210ENST00000541960 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
GABARAPL1-210ENST00000541960 IGF1RP08069 1367 aa27.78■■■□□ 2.04
GABARAPL1-210ENST00000541960 CLIP1P30622 1438 aa27.75■■■□□ 2.03
GABARAPL1-210ENST00000541960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.72■■■□□ 2.03
GABARAPL1-210ENST00000541960 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
GABARAPL1-210ENST00000541960 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.61■■■□□ 2.01
GABARAPL1-210ENST00000541960 WDR97A6NE52 1622 aa27.6■■■□□ 2.01
GABARAPL1-210ENST00000541960 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.54■■■□□ 2
GABARAPL1-210ENST00000541960 HRCP23327 699 aa27.54■■■□□ 2
GABARAPL1-210ENST00000541960 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.51■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 ARAP1Q96P48 1450 aa27.48■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.48■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
GABARAPL1-210ENST00000541960 CUL7Q14999 1698 aa27.41■■□□□ 1.98
GABARAPL1-210ENST00000541960 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.4■■□□□ 1.98
GABARAPL1-210ENST00000541960 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.4■■□□□ 1.98
GABARAPL1-210ENST00000541960 WDR62O43379 1518 aa27.36■■□□□ 1.97
GABARAPL1-210ENST00000541960 ERCC6Q03468 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
GABARAPL1-210ENST00000541960 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
GABARAPL1-210ENST00000541960 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
GABARAPL1-210ENST00000541960 IFT140Q96RY7 1462 aa27.21■■□□□ 1.95
GABARAPL1-210ENST00000541960 PBRM1Q86U86 1689 aa27.2■■□□□ 1.95
GABARAPL1-210ENST00000541960 APLP2Q06481 763 aa27.2■■□□□ 1.95
GABARAPL1-210ENST00000541960 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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