RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 RTL10Q7L3V2 364 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 SNX21Q969T3 373 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 NELL2Q99435 816 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 BRD9Q9H8M2 597 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ZNF711Q9Y462 761 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 FRYLO94915 3013 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 PROB1E7EW31 1015 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 MATN2O00339 956 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 KCNK3O14649 394 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 TSPAN6O43657 245 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 FZD7O75084 574 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 GLULP15104 373 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 BMPR1AP36894 532 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 NDUFV1P49821 464 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 PPP2R5CQ13362 524 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 CAMK1Q14012 370 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 APBB2Q92870 758 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 CENPOQ9BU64 300 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 A6NCN8 305 aa8.21□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.21□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.21□□□□□ -1.09
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LMO3-212ENST00000535535 FBXO10Q9UK96 956 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-212ENST00000535535 ABCB11O95342 1321 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ERLIN2O94905 339 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CSPG5O95196 566 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GLP2RO95838 553 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.2□□□□□ -1.1
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