RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528066.1

RCOR3-209, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-209	ENST00000528066	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MAML1	Q92585	1016 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FRYL	O94915	3013 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYH1	P12882	1939 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYO1C	O00159	1063 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FRS3	O43559	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TLR5	O60602	858 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TTLL1	O95922	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HRG	P04196	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ERBB2	P04626	1255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PGK2	P07205	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	LRPAP1	P30533	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC7A1	P30825	629 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CDK7	P50613	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	E2F2	Q14209	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GBX1	Q14549	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	COG2	Q14746	738 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GRM3	Q14832	879 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	BCAR3	O75815	825 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	CIAO1	O76071	339 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	NXPH3	O95157	252 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	BAG3	O95817	575 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	GPD1	P21695	349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	LIPA	P38571	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RCOR3-209	ENST00000528066	DGKE	P52429	567 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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