RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM24O15164 1050 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB4AP04350 444 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 PRLRP16471 622 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 HCAR3P49019 387 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS2P61201 443 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 E2F7Q96AV8 911 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 APOL1O14791 398 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD11O43934 449 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 C5orf22Q49AR2 442 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC181Q5TID7 509 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TYRP14679 529 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 MPPE1Q53F39 396 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A4Q6AI14 798 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 KLC2Q9H0B6 622 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ECT2Q9H8V3 914 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf40Q86WS4 652 aa23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN7P35236 360 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX9P48436 509 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 BBS12Q6ZW61 710 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP2A3Q93084 1043 aa23.36■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.36■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 MFN1Q8IWA4 741 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC23Q9UJX2 597 aa23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ARNTLO00327 626 aa23.35■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 RUNX3Q13761 415 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TFDP2Q14188 446 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 VSIG1Q86XK7 387 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 DTLQ9NZJ0 730 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF487B1APH4 448 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 DFFAO00273 331 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN11O75508 207 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 NFATC1O95644 943 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ACVRL1P37023 503 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A11P48066 632 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZP2Q05996 745 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX1Q13596 522 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH18Q13634 790 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 GAB4Q2WGN9 574 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A8Q9C0K1 460 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CES2O00748 559 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ADH1CP00326 375 aa23.34■■□□□ 1.33
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