RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 IP6K1Q92551 441 aa4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 KAT2AQ92830 837 aa4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 RTKNQ9BST9 563 aa4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0G2JK05 382 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 PROB1E7EW31 1015 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ACTL6BO94805 426 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ALPLP05186 524 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CYP3A4P08684 503 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 IGFBP2P18065 325 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ITGB6P18564 788 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CYP3A7P24462 503 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CDC25AP30304 524 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ICA1Q05084 483 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 PMPCAQ10713 525 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MAPK7Q13164 816 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MDGA2Q7Z553 956 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 C3orf49Q96BT1 292 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FZD3Q9NPG1 666 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 H0YGN5 161 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ATG13O75143 517 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 TOMM40O96008 361 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 FGF2P09038 288 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 HTR3AP46098 478 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 RCAN1P53805 252 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 AP2B1P63010 937 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ASB5Q8WWX0 329 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 LPAR1Q92633 364 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 ATP2A3Q93084 1043 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 DACT1Q9NYF0 836 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 DAPP1Q9UN19 280 aa4.72□□□□□ -1.65
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 MCIDASD6RGH6 385 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 SYT5O00445 386 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 SERPINF1P36955 418 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 PCP4P48539 62 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 HTR6P50406 440 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ADPRHP54922 357 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 UBE4AQ14139 1066 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM60Q495X7 471 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ALG10Q5BKT4 473 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 RRAGAQ7L523 313 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 KLBQ86Z14 1044 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 EXD3Q8N9H8 876 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 POF1BQ8WVV4 589 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 CPT1BQ92523 772 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 RSC1A1Q92681 617 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 EID2BQ96D98 161 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ARL15Q9NXU5 204 aa4.71□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 ACKR2O00590 384 aa4.7□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 KCNAB3O43448 404 aa4.7□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNA5P30532 468 aa4.7□□□□□ -1.66
CPEB4-210ENST00000522344 POLD2P49005 469 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms