RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CSRP2Q16527 193 aa19.3■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ALFQ53S48 1182 aa19.3■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM22Q9P0K1 906 aa19.3■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC185Q8N715 623 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP2-218ENST00000511185 SIPA1Q96FS4 1042 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP2-218ENST00000511185 SIN3BO75182 1162 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF217O75362 1048 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ENDOD1O94919 500 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CAVIN2O95810 425 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 F9P00740 461 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ASLP04424 464 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT3P12035 628 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 GPD1P21695 349 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN9P43378 593 aa19.25■□□□□ 0.67
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