RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509165.1

NFKB1-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 1, human

TSL 5

Gene NFKB1, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB1-208	ENST00000509165	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	COQ9	O75208	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	MOSPD3	O75425	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CHRNA5	P30532	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	GALNS	P34059	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	THBS4	P35443	961 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ETFDH	Q16134	617 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	PRC1	O43663	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	RNF8	O76064	485 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	DGKQ	P52824	942 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CFHR1	Q03591	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165		Q4G0T1	1027 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	HTT	P42858	3142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	DSCR3	O14972	297 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	NEK3	P51956	506 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	AK2	P54819	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TMF1	P82094	1093 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	VPS16	Q9H269	839 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFKB1-208	ENST00000509165	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165		M0QZQ0	153 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	RRH	O14718	337 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	MYL1	P05976	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	JAK3	P52333	1124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	GAB1	Q13480	694 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NFKB1-208	ENST00000509165	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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