RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 SPTBN4Q9H254 2564 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 C2CD4BA6NLJ0 364 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 MOCS3O95396 460 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 KRT3P12035 628 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 COPAP53621 1224 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 PLEKHG6Q3KR16 790 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC14Q49A88 953 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 PRR23CQ6ZRP0 262 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 LPCAT2Q7L5N7 544 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 TMPRSS6Q8IU80 811 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 MTG2Q9H4K7 406 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 TAS2R14Q9NYV8 317 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa30.2■■■□□ 2.43
FBXO18-208ENST00000470089 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF217O75362 1048 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ASLP04424 464 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SDC4P31431 198 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 GSCP56915 257 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ACAD10Q6JQN1 1059 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 C3orf20Q8ND61 904 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SIPA1Q96FS4 1042 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 MYO19Q96H55 970 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 HAUS4Q9H6D7 363 aa30.19■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TMCO5BA8MYB1 307 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CNTN5O94779 1100 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PBX1P40424 430 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ST8SIA6P61647 398 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 LMNB2Q03252 620 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 DNAJC24Q6P3W2 148 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 OR52K2Q8NGK3 314 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 OR2T3Q8NH03 318 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RMDN1Q96DB5 314 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 MRGPRX3Q96LB0 322 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 AIPL1Q9NZN9 384 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 IFNKQ9P0W0 207 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ERVW-1Q9UQF0 538 aa30.18■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ENDOD1O94919 500 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PTGER3P43115 390 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 C5orf22Q49AR2 442 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ALFQ53S48 1182 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PLA2G2CQ5R387 149 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CYP2U1Q7Z449 544 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF683Q8IZ20 524 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 EDEM3Q9BZQ6 932 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PRSS16Q9NQE7 514 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM51Q9NW97 253 aa30.17■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 DOCK4Q8N1I0 1966 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF806P0C7X5 589 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SKILP12757 684 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PTPN9P43378 593 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ID4P47928 161 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 ECT2LQ008S8 904 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SLC12A1Q13621 1099 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 FIGNQ5HY92 759 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TCEAL6Q6IPX3 200 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 WDR59Q6PJI9 974 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SLC36A4Q6YBV0 504 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 DNAAF5Q86Y56 855 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 MCOLN2Q8IZK6 566 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TCEAL3Q969E4 200 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SUN2Q9UH99 717 aa30.16■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CEP250Q9BV73 2442 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 GON4LQ3T8J9 2241 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SIGLEC16A6NMB1 481 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SRGAP2O75044 1071 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CLDN11O75508 207 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 GPD1P21695 349 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RRM1P23921 792 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 STK19P49842 368 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 CDH4P55283 916 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 KLHL30Q0D2K2 578 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 LRRC31Q6UY01 552 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 FAM172AQ8WUF8 416 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 PIGKQ92643 395 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 C1orf74Q96LT6 269 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 HAPLN3Q96S86 360 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 VPS45Q9NRW7 570 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 MPP6Q9NZW5 540 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa30.15■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 TTC34A8MYJ7 566 aa30.14■■■□□ 2.42
FBXO18-208ENST00000470089 E9PAM4 449 aa30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms