RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	TM4SF4	P48230	202 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	DIO1	P49895	249 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	RENBP	P51606	427 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	LMAN2	Q12907	356 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	PRKG1	Q13976	671 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SMC5	Q8IY18	1101 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MMS19	Q96T76	1030 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	VPS33B	Q9H267	617 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	TISP43	B9A030	160 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080		H7C1Q1	480 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MYL4	P12829	197 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	RBL1	P28749	1068 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MCM5	P33992	734 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	COPA	P53621	1224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	AK2	P54819	239 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	GRAP	Q13588	217 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	FHL3	Q13643	280 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CHSY1	Q86X52	802 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC138	Q96M89	665 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MXD3	Q9BW11	206 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	HTR7	P34969	479 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	TUBA4A	P68366	448 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	DEUP1	Q05D60	604 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	COLEC12	Q5KU26	742 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	OR2C3	Q8N628	320 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	DDB2	Q92466	427 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	SNX15	Q9NRS6	342 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	FNIP2	Q9P278	1114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM17-208	ENST00000467080	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080		A8MVJ9	347 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	PRRT4	C9JH25	899 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	TMPRSS11D	O60235	418 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	COQ9	O75208	318 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	FGF18	O76093	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	NDST3	O95803	873 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	CLCA4	Q14CN2	919 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	ST3GAL2	Q16842	350 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	FAXC	Q5TGI0	409 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	DENND2C	Q68D51	928 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	RITA1	Q96K30	269 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	MYD88	Q99836	296 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	GDF15	Q99988	308 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	CGB1	A6NKQ9	187 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	BBOX1	O75936	387 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	AR	P10275	920 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	GABRB3	P28472	473 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	GPS1	Q13098	491 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	BRD3	Q15059	726 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM17-208	ENST00000467080	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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