RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 AGPSO00116 658 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 GNGT2O14610 69 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ACSL3O95573 720 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 KDELR1P24390 212 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PTPN9P43378 593 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ARL4CP56559 192 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TTC27Q6P3X3 843 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TBK1Q9UHD2 729 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MAFFQ9ULX9 164 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 APOL1O14791 398 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CKBP12277 381 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 NCAM1P13591 858 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TRIM16LQ309B1 348 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ACCSLQ4AC99 568 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ACAD11Q709F0 780 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FAM228AQ86W67 206 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ALLCQ8N6M5 410 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CITO14578 2027 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SYCE1LA8MT33 242 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 APOC2P02655 101 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ECHS1P30084 290 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CDKN2BP42772 138 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ITGA8P53708 1063 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CDH6P55285 790 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DSG1Q02413 1049 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CDH18Q13634 790 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 UBXN11Q5T124 520 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 HSPH1Q92598 858 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MTBPQ96DY7 904 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PGM2Q96G03 612 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 NR2E1Q9Y466 385 aa7.85□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 E5RJQ4 531 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 IRF1P10914 325 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TSHRP16473 764 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 MIPP30301 263 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CHKAP35790 457 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 KCNJ1P48048 391 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 GJA8P48165 433 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 AIF1P55008 147 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ROR1Q01973 937 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 UBE3AQ05086 875 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 GPM6BQ13491 265 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TWNKQ96RR1 684 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SIK2Q9H0K1 926 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DIABLOQ9NR28 239 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CHST7Q9NS84 486 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 COMMD8Q9NX08 183 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ANK1P16157 1881 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ZNF839A8K0R7 811 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 CST8O60676 142 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 LRCH4O75427 683 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ARSEP51690 589 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 ZNF844Q08AG5 666 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 PDK1Q15118 436 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms