RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 UGP2Q16851 508 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DCAF6Q58WW2 860 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AAGABQ6PD74 315 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PACS1Q6VY07 963 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RFX8Q6ZV50 586 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF534Q76KX8 674 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 P2RY11Q96G91 374 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 EPAS1Q99814 870 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 IL22Q9GZX6 179 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GPAMQ9HCL2 828 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HACD3Q9P035 362 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZFATQ9P243 1243 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DSEQ9UL01 958 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CDH9Q9ULB4 789 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CAPN14A8MX76 684 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 M0QYT0 321 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DCLK1O15075 740 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PLIN3O60664 434 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CBX6O95503 412 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AP2A1O95782 977 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PDGFRBP09619 1106 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FGFR1P11362 822 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CCL5P13501 91 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GOT1P17174 413 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V1C1P21283 382 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 EPHB2P29323 1055 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TYK2P29597 1187 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HOXC8P31273 242 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PGM1P36871 562 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB8P50452 374 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RAB27AP51159 221 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC34A1Q06495 639 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AP1B1Q10567 949 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MTA1Q13330 715 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DPYSQ14117 519 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TAF11Q15544 211 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TEX44Q53QW1 395 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RAB41Q5JT25 222 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MROH9Q5TGP6 573 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CASC4Q6P4E1 433 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PID1Q7Z2X4 250 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RNF180Q86T96 592 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TMEM135Q86UB9 458 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 METTL23Q86XA0 190 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.017e-13■■■□□ 15.3
ACTB-208ENST00000464611 CCNYQ8ND76 341 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TRPV1Q8NER1 839 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PTPRN2Q92932 1015 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HDAC11Q96DB2 347 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CERS2Q96G23 380 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RILPQ96NA2 401 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TSGA13Q96PP4 275 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 OSMRQ99650 979 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MED10Q9BTT4 135 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.72□□□□□ -1.01
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