RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452495.1

TRAPPC12-211, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 4

Gene TRAPPC12, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-211ENST00000452495 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FAM72BQ86X60 149 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 AHI1Q8N157 1196 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FAM71BQ8TC56 605 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 HSPH1Q92598 858 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FOXQ1Q9C009 403 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 DONSONQ9NYP3 566 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 GGA2Q9UJY4 613 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ALG6Q9Y672 507 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 NUP205Q92621 2012 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 A0A0A0MRY4 1105 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 A0A0U1RQJ8 604 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CREB3O43889 395 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CNTN5O94779 1100 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CD72P21854 359 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 EPHB2P29323 1055 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 HLA-FP30511 346 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 GJC1P36383 396 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 MAGEA9P43362 315 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TNFRSF4P43489 277 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 HCAR3P49019 387 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KRT81Q14533 505 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 DMC1Q14565 340 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 PDK2Q15119 407 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 E2F5Q15329 346 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ALFQ53S48 1182 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 C6orf118Q5T5N4 469 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 NLRP14Q86W24 1093 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 VSIG1Q86XK7 387 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CCDC105Q8IYK2 499 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 LRRC57Q8N9N7 239 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FLCNQ8NFG4 579 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 WFDC5Q8TCV5 224 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ATRIPQ8WXE1 791 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF670Q9BS34 389 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 IER2Q9BTL4 223 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 EPHX3Q9H6B9 360 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ABCB8Q9NUT2 735 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF212Q9UDV6 495 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 FAM170BA6NMN3 283 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 WASH4PA8MWX3 477 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF487B1APH4 448 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 STK25O00506 426 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZSCAN12O43309 604 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 MOCS3O95396 460 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 EGFP01133 1207 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CHRNB1P11230 501 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 AOC1P19801 751 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 OR1E1P30953 314 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ETFBP38117 255 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ARSEP51690 589 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CLCN5P51795 746 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CDH6P55285 790 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 LMAN2Q12907 356 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 RFX8Q6ZV50 586 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 TSC1Q92574 1164 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 CLDN23Q96B33 292 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 LMLNQ96KR4 655 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 MPP6Q9NZW5 540 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC12-211ENST00000452495 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms