RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 FYB2Q5VWT5 728 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 USP30Q70CQ3 517 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 NAT16Q8N8M0 369 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IRGQQ8WZA9 623 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SDCBP2Q9H190 292 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CACNA1EQ15878 2313 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQH9 124 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PRRT4C9JH25 899 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KLRC4O43908 158 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 FSBPO95073 299 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC130P13994 396 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 OXR1Q8N573 874 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 NELFBQ8WX92 580 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IGSF8Q969P0 613 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 DESI2Q9BSY9 194 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 LHX5Q9H2C1 402 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 NAGPAQ9UK23 515 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KLK13Q9UKR3 277 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PTPRBP23467 1997 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CAPN8A6NHC0 703 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP6O43182 974 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 TNFSF14O43557 240 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IRF1P10914 325 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 GRK6P43250 576 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 UBASH3AP57075 661 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ARID5AQ03989 594 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 RING1Q06587 406 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 MESP2Q0VG99 397 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 NNTQ13423 1086 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 MEA1Q16626 185 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 FUT11Q495W5 492 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KRT39Q6A163 491 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 BEND5Q7L4P6 421 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 AHI1Q8N157 1196 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PMM2O15305 246 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CYP26A1O43174 497 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 TPMTP51580 245 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 BCAT1P54687 386 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IFT88Q13099 833 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ILKQ13418 452 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SCD5Q86SK9 330 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRR-204ENST00000440835 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 HPS3Q969F9 1004 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 THAP9Q9H5L6 903 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KLC4Q9NSK0 619 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 CDC23Q9UJX2 597 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 AGPSO00116 658 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-204ENST00000440835 KIF5CO60282 957 aa6.23□□□□□ -1.41
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