RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MSL3P1P0C860 447 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 P4HA1P13674 534 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FGFR3P22607 806 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIL2Q13356 520 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AP3B2Q13367 1082 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP161Q6P656 301 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf74Q96LT6 269 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC138Q96M89 665 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF778Q96MU6 729 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 COG8Q96MW5 612 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 OLAHQ9NV23 265 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RLFQ13129 1914 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TISP43B9A030 160 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L15C9J2P7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L11C9JVI0 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L18D6R9N7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L22D6RA61 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L19D6RCP7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L20D6RJB6 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PLOD2O00469 737 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DCXO43602 365 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB2P25686 324 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRB3P28472 473 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B4P51659 736 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PKNOX1P55347 436 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEP78395 509 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L24Q0WX57 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BMPR2Q13873 1038 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBED5Q49AG3 693 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CADM3Q8N126 398 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1NQ8N819 430 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KCT2Q8NC54 265 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CPT1BQ92523 772 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CTRCQ99895 268 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH19Q9H159 772 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH7Q9ULB5 785 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NOTOA8MTQ0 251 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PROSCO94903 275 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 WEE2P0C1S8 567 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CD1EP15812 388 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 THOP1P52888 689 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 COX10Q12887 443 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR16Q569H4 304 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FIBCD1Q8N539 461 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TANKQ92844 425 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 WBP1LQ9NX94 342 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 STK39Q9UEW8 545 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PRELID1Q9Y255 219 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KBTBD13C9JR72 458 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL11O14625 94 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CFLARO15519 480 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms