RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435532.7

NEDD4-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4, Length 5,869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4-202ENST00000435532 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TBC1D4O60343 1298 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 DUSP4Q13115 394 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MTM1Q13496 603 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 WDR59Q6PJI9 974 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KCNMB4Q86W47 210 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SPATA31D3P0C874 917 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 VAV3Q9UKW4 847 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TISP43B9A030 160 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 OPLAHO14841 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CENPAP49450 140 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CSHL1Q14406 222 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 GNPTGQ9UJJ9 305 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ASTN1O14525 1302 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 B4GALT4O60513 344 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 RFX3P48380 749 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PPP3CAQ08209 521 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 BSNDQ8WZ55 320 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ECSITQ9BQ95 431 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TMCO1Q9UM00 188 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM114B3SHH9 223 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CATP04040 527 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ITGB6P18564 788 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TYMPP19971 482 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 APOC2P02655 101 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 STX5Q13190 355 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 GPM6BQ13491 265 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 HYIQ5T013 277 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TTC7BQ86TV6 843 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 QRFPRQ96P65 431 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CPNE1Q99829 537 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CERS4Q9HA82 394 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TSPAN1O60635 241 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PGM1P36871 562 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 FANCEQ9HB96 536 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PADI4Q9UM07 663 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CFAP73A6NFT4 308 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 UBXN8O00124 270 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CXCR2P25025 360 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MAGEC1O60732 1142 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PRKAA2P54646 552 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 DLG4P78352 724 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KDSRQ06136 332 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 GALNTL6Q49A17 601 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SPATA20Q8TB22 786 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 UBE2E3Q969T4 207 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 INSL6Q9Y581 213 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KATNA1O75449 491 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 FTH1P02794 183 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 GPR88Q9GZN0 384 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM120BA0PK00 339 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 TEAD4Q15561 434 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 PGS1Q32NB8 556 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 MYOM1P52179 1685 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD4-202ENST00000435532 KLHL35Q6PF15 583 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms