RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NTHL1P78549 312 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LMAN2Q12907 356 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TTC22Q5TAA0 569 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CEP85Q6P2H3 762 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DOK3Q7L591 496 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CDHR1Q96JP9 859 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SCLT1Q96NL6 688 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ITPR1Q14643 2758 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 TGM5O43548 720 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 ANAPC15P60006 121 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DSG1Q02413 1049 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CREMQ03060 361 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PLK5Q496M5 336 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LONRF3Q496Y0 759 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CASC1Q6TDU7 716 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 XYLT1Q86Y38 959 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NXPE1Q8N323 547 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 METTL13Q8N6R0 699 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ITFG1Q8TB96 612 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DKK2Q9UBU2 259 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF263O14978 683 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ATG13O75143 517 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 NCR1O76036 304 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 REC8O95072 547 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SNHG28P0DPA3 235 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CD40P25942 277 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GDI1P31150 447 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 WNT3AP56704 352 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 IRX4P78413 519 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NUCB2P80303 420 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SYT12Q8IV01 421 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 YAF2Q8IY57 180 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRK-211ENST00000429595 MSANTD3Q96H12 275 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MAP7D2Q96T17 732 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TEX101Q9BY14 249 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 KAT14Q9H8E8 782 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GDE1Q9NZC3 331 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WV48 116 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PR48 441 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CCL16O15467 120 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ORC4O43929 436 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 HBP1O60381 514 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 RFPL3O75679 317 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 VTNP04004 478 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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