RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CPXM1Q96SM3 734 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FZD4Q9ULV1 537 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 NUMA1Q14980 2115 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVT2 93 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf142B7Z368 130 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FLRT2O43155 660 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CCR1P32246 355 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CDK17Q00537 523 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CST6Q15828 149 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK4Q16566 473 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 NOX5Q96PH1 765 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MTG2Q9H4K7 406 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVM2 712 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-34P06331 123 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB4P21439 1286 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PLK1P53350 603 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 OXCT1P55809 520 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PTK2Q05397 1052 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TAF5Q15542 800 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SIX2Q9NPC8 291 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 DDIT4Q9NX09 232 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.67■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FSBPO95073 299 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 USP8P40818 1118 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SNX16P57768 344 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 APBA1Q02410 837 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SULT2A1Q06520 285 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 KIF19Q2TAC6 998 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 APCDD1Q8J025 514 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB106AQ8N104 65 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF8Q969P0 613 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM131Q92545 1883 aa21.66■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CHD6Q8TD26 2715 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGF2RP11717 2491 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNA2O75051 1894 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPC4 97 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TTC34A8MYJ7 566 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MID1O15344 667 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ADH1BP00325 375 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 GALCP54803 685 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MAN2A1Q16706 1144 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRN2Q92932 1015 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 FAM129BQ96TA1 746 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CDC6Q99741 560 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CEP83Q9Y592 693 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PP55 124 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC72A6NJI9 287 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA12O60330 932 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DFNA5O60443 496 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DAB1O75553 588 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DKK1O94907 266 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 C5AR1P21730 350 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC8A1P32418 973 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NNMTP40261 264 aa21.64■■□□□ 1.05
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