RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL31Q9H511 634 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 WDR41Q9HAD4 459 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 RAD54BQ9Y620 910 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CCNG1P51959 295 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MEA1Q16626 185 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GRTP1Q5TC63 336 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL1Q9NR64 748 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RGS18Q9NS28 235 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GAKO14976 1311 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PRRG1O14668 218 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CD151P48509 253 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SNX17Q15036 470 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SIX5Q8N196 739 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 C19orf60Q96EN9 201 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CPB2Q96IY4 423 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ACTR8Q9H981 624 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PADI4Q9UM07 663 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SMIM22K7EJ46 135 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ANPEPP15144 967 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMC7Q7Z402 723 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP20Q9Y2K6 914 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PIGNO95427 931 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ERAP2Q6P179 960 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 APBA2Q99767 749 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CLPBQ9H078 707 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POMKQ9H5K3 350 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POLG2Q9UHN1 485 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RCCD1A6NED2 376 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 H3BRB1 525 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PSMA3P25788 255 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 LRPAP1P30533 357 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PGM5Q15124 567 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMC2Q8TDI7 906 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SETD4Q9NVD3 440 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP12O75317 370 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 BANF1O75531 89 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLC20A2Q08357 652 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ARMC3Q5W041 872 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PARP8Q8N3A8 854 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DNERQ8NFT8 737 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ITFG1Q8TB96 612 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 APBB2Q92870 758 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PWWP2AQ96N64 755 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 APOL4Q9BPW4 351 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FANCEQ9HB96 536 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EHD3Q9NZN3 535 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 UBXN8O00124 270 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CALCAP01258 141 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GARTP22102 1010 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CDH18Q13634 790 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms