RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 HMG20AQ9NP66 347 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 AAASQ9NRG9 546 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD51BO15315 384 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CETPP11597 493 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TPH1P17752 444 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL12AP19105 171 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ADRA1DP25100 572 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NUMBP49757 651 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 COX10Q12887 443 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DGUOKQ16854 277 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GRTP1Q5TC63 336 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NMRAL1Q9HBL8 299 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RRN3Q9NYV6 651 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MYH3P11055 1940 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C4K7 107 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RAMP2O60895 175 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TTKP33981 857 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH9A1P49189 494 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMB2P55268 1798 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT73Q86Y46 540 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TATDN2Q93075 761 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP41Q9BYV8 373 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CIPCQ9C0C6 399 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CES2O00748 559 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM153BP0C7A2 387 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNT1Q02742 428 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM153CQ494X1 144 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF180Q86T96 592 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DSEQ9UL01 958 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KATNA1O75449 491 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IL6P05231 212 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CAP2P40123 477 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NPY2RP49146 381 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK16Q00536 496 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF3Q13114 568 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TAB1Q15750 504 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CNGA2Q16280 664 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC73Q6P1J9 531 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MTSS1LQ765P7 747 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35C1Q96A29 364 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM159Q96B96 161 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NUAK2Q9H093 628 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTLC1O15269 473 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC22BO75396 215 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB2P25686 324 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAAP100Q0VG06 881 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC7Q7Z402 723 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TEKT5Q96M29 485 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms