RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RIOX2Q8IUF8 465 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AHI1Q8N157 1196 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1NQ8N819 430 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RY11Q96G91 374 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR22Q99680 433 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 COG4Q9H9E3 785 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HHLA1C9JL84 531 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX3O60479 287 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE5AO76074 875 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PYGLP06737 847 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C8BP07358 591 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNGP07510 517 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 THRAP10827 490 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MCF2P10911 925 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SKIP12755 728 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCN3P51790 818 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TBCCQ15814 346 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR44Q5JSH3 913 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB41Q5JT25 222 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 UBXN11Q5T124 520 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF410Q86VK4 478 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF567Q8N184 647 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF149Q8NC42 400 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM40Q8WWA1 233 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZWILCHQ9H900 591 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ASLP04424 464 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ERFP50548 548 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NDST1P52848 882 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CRADDP78560 199 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TADA1Q96BN2 335 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS10Q9H324 1103 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CASS4Q9NQ75 786 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SGK1O00141 431 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOX3O15254 700 aa3.72□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 BEST1O76090 585 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C2P06681 752 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MTHFD2P13995 350 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 USP4Q13107 963 aa3.72□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RTKN2Q8IZC4 609 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS5Q92905 334 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD3Q96ES6 412 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS2O43903 313 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNA4P22459 653 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GRK2P25098 689 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 BASP1P80723 227 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 SULT2A1Q06520 285 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 STX3Q13277 289 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HERC3Q15034 1050 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST13Q8NET6 341 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RBBP8Q99708 897 aa3.72□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 MUC3BQ9H195 1237 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TREX1Q9NSU2 369 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PQ18 207 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ETS2P15036 469 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2B6P20813 491 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA3P25788 255 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAR1P56945 870 aa3.71□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF699Q32M78 642 aa3.71□□□□□ -1.81
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