RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ZNF567Q8N184 647 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PLIN3O60664 434 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MYL4P12829 197 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 GP5P40197 560 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CES4AQ5XG92 561 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MBLAC2Q68D91 279 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 RINLQ6ZS11 566 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 VAT1Q99536 393 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TAGLN3Q9UI15 199 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB16A2A368 324 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 F8W8V4 182 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 AP3B1O00203 1094 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 F9P00740 461 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ITGA2BP08514 1039 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA12P43365 314 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CDK7P50613 346 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 DNAL1Q4LDG9 190 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD5O75356 428 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 AP2A1O95782 977 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB2P25686 324 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PSMB4P28070 264 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TKTL1P51854 596 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 DAOAP59103 153 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 HIC1Q14526 733 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 RAB41Q5JT25 222 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 EMCNQ9ULC0 261 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PTGESO14684 152 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SERPINE1P05121 402 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MX2P20592 715 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 AQP5P55064 265 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TAF11Q15544 211 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 KCNA10Q16322 511 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CCDC153Q494R4 210 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TMEM135Q86UB9 458 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 GPATCH11Q8N954 259 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CCNYQ8ND76 341 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PGBD4Q96DM1 585 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CERS2Q96G23 380 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PIGVQ9NUD9 493 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TPP1O14773 563 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TREHO43280 583 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 AOC1P19801 751 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ZNF33AQ06730 810 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 WSCD1Q658N2 575 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PID1Q7Z2X4 250 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TTC7BQ86TV6 843 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TTC8Q8TAM2 541 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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PMS1-205ENST00000409985 SYBUQ9NX95 663 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ZFATQ9P243 1243 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CREB3O43889 395 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 BEST1O76090 585 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 FYNP06241 537 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ASGR1P07306 291 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MYL3P08590 195 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 HDAC11Q96DB2 347 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MED10Q9BTT4 135 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 BFARQ9NZS9 450 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 USP1O94782 785 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 KLHL2O95198 593 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PROCP04070 461 aa24.34■■□□□ 1.49
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