RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 L1CAMP32004 1257 aa15.85■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.83■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 LONP2Q86WA8 852 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.83■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.83■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF26Q96DR7 871 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 GABRG3Q99928 467 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM7Q9C029 511 aa15.83■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 EBF1Q9UH73 591 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 CNTN5O94779 1100 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 LRIG2O94898 1065 aa15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 WASP42768 502 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPKAPK2P49137 400 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 GSDMDP57764 484 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ECT2LQ008S8 904 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP2Q13822 863 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF234Q14588 700 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 FUT11Q495W5 492 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ALFQ53S48 1182 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM215Q68D42 235 aa15.82■□□□□ 0.12
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