RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TIFABQ6ZNK6 161 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB106AQ8N104 65 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 EBF4Q9BQW3 602 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PTTG2Q9NZH5 202 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MEI4A8MW99 385 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RNF103O00237 685 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TPP1O14773 563 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 UQCRBP14927 111 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ACADSBP45954 432 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB6Q15916 424 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DCAF6Q58WW2 860 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PACS1Q6VY07 963 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ARCQ7LC44 396 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DHDDSQ86SQ9 333 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ATP2A3Q93084 1043 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 OSMRQ99650 979 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 GPAMQ9HCL2 828 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KPNA7A9QM74 516 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 HACD1B0YJ81 288 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 VILLO15195 856 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD11O43934 449 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RECQL4O94761 1208 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KCNA4P22459 653 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP8P85298 464 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ASPHQ12797 758 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CES3Q6UWW8 571 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PGBD4Q96DM1 585 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 P2RY11Q96G91 374 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TXNDC16Q9P2K2 825 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 FZD10Q9ULW2 581 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.51□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TXNDC9O14530 226 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ITM2AO43736 263 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MLNP12872 115 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 VCLP18206 1134 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PEX2P28328 305 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 RGS2P41220 211 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 MATKP42679 507 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 WASHC5Q12768 1159 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PDK3Q15120 406 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 NOTUMQ6P988 496 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 STRADAQ7RTN6 431 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CRYBG2Q8N1P7 616 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC106Q9BWC9 280 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 S100A14Q9HCY8 104 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 GJD2Q9UKL4 321 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 E2F8A0AVK6 867 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SPTLC1O15269 473 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 GLRA3O75311 464 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SMIM18P0DKX4 95 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PSMB4P28070 264 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SLC1A6P48664 564 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CCNA1P78396 465 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 ADIGQ0VDE8 80 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 NME3Q13232 169 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 TMED1Q13445 227 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 STEAP4Q687X5 459 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 FBXL19Q6PCT2 694 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 CYS1Q717R9 158 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 HACE1Q8IYU2 909 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 APPL2Q8NEU8 664 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-202ENST00000375175 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms