RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT2BQ92831 832 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ARRDC3Q96B67 414 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR26Q9H7D7 661 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 E5RJQ4 531 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPT4O43236 478 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ACP5P13686 325 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TFEBP19484 476 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 RXRAP19793 462 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPH2P23942 346 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CPA2P48052 419 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC12A2P55011 1212 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF91Q05481 1191 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 EFR3AQ14156 821 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 C2CD5Q86YS7 1000 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CPXCR1Q8N123 301 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM47BQ8NA70 645 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 GCC1Q96CN9 775 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 RMI1Q9H9A7 625 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.721e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-202ENST00000370826 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 DERAQ9Y315 318 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 MCIDASD6RGH6 385 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM10O14672 748 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 LYL1P12980 280 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CCT5P48643 541 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 BIRC3Q13489 604 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PGM5Q15124 567 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 Q4G0T1 1027 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 MORN5Q5VZ52 161 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 MTFR2Q6P444 385 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 DEF8Q6ZN54 512 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM57BQ71RH2 274 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 LINS1Q8NG48 757 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ9Q92806 393 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL5Q93034 780 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 COG8Q96MW5 612 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CLPBQ9H078 707 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PKP3Q9Y446 797 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR91A4D1P6 747 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ18B7U540 433 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 STX16O14662 325 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TLR2O60603 784 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 UGDHO60701 494 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CSF1P09603 554 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 AVPR2P30518 371 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PNPLA4P41247 253 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ID2Q02363 134 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3AQ14563 771 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 IP6K1Q92551 441 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 COQ8BQ96D53 544 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 RASSF1Q9NS23 344 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.28□□□□□ -1.72
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