RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 KCNN4O15554 427 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 AMHP03971 560 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 KRT3P12035 628 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PMS2P3Q13401 168 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SEPT6Q14141 434 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 KRBA1A5PL33 1030 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TADA2AO75478 443 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 RHDQ02161 417 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 C9IYK1 514 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 AKAP10O43572 662 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 HSPA4LO95757 839 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PPM1JQ5JR12 505 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 C4orf19Q8IY42 314 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TERB1Q8NA31 727 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ACDQ96AP0 544 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PGBD4Q96DM1 585 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 OLFM1Q99784 485 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CFAP99D6REC4 459 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TRIM38O00635 465 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SNAP91O60641 907 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PAX3P23760 479 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PRAMEP78395 509 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ART3Q13508 389 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 RAB39AQ14964 217 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 XKR9Q5GH70 373 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZNF786Q8N393 782 aa22.23■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ENDOD1O94919 500 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 VAPBO95292 243 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.151e-6■■■■□ 21
OPN3-201ENST00000366554 MX2P20592 715 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 MIPP30301 263 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 HERC3Q15034 1050 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TAMM41Q96BW9 452 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 DHRS1Q96LJ7 313 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 MAFGO15525 162 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ALDH1A2O94788 518 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 GNAO1P09471 354 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CERS5Q8N5B7 392 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ADAM32Q8TC27 787 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.22■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 RBL1P28749 1068 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ITGADQ13349 1161 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 ZNF358Q9NW07 568 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 CKMT2P17540 419 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 GMPRP36959 345 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 OXA1LQ15070 435 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PHKG1Q16816 387 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 EMC1Q8N766 993 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 POLLQ9UGP5 575 aa22.21■■□□□ 1.15
OPN3-201ENST00000366554 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
OPN3-201ENST00000366554 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms