RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 STUB1Q9UNE7 303 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RGSL1A5PLK6 1076 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DHFRP00374 187 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AKR1B1P15121 316 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MMP13P45452 471 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RAB27AP51159 221 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PPATQ06203 517 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF33AQ06730 810 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MTMR2Q13614 643 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP1A4Q13733 1029 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PPM1NQ8N819 430 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CD101Q93033 1021 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 EURLQ9NYK6 297 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM10Q9UDY6 481 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SNX24Q9Y343 169 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BCL9O00512 1426 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0B4J269 797 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM189A1O60320 539 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PLA2G6O60733 806 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFS3O75489 264 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN9O75954 239 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SPDYE6P0CI01 402 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 IL1R1P14778 569 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NOGQ13253 232 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TUBB3Q13509 450 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RBBP7Q16576 425 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SFR1Q86XK3 245 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 YAF2Q8IY57 180 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CYGBQ8WWM9 190 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GMCL1Q96IK5 515 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf26Q96N11 449 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PANX3Q96QZ0 392 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 COQ7Q99807 217 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 VPS51Q9UID3 782 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UNCXA6NJT0 531 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RGS5O15539 181 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATG7O95352 703 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 VDRP11473 427 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PDGFRAP16234 1089 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GRIA2P42262 883 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0D1P61421 351 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ITKQ08881 620 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF235Q14590 738 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TCEAL1Q15170 157 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DDI2Q5TDH0 399 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SHC4Q6S5L8 630 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZPBP2Q6X784 338 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SLIT2O94813 1529 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ITIH1P19827 911 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FGFR3P22607 806 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GSTM5P46439 218 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GALCP54803 685 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms