RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A3Q99624 504 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NUP85Q9BW27 656 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB6Q9NP58 842 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PARP14Q460N5 1801 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PP55 124 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ESPNB1AK53 854 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATP9BO43861 1147 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN11O75508 207 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ELFN1P0C7U0 828 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CYP11B1P15538 503 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TACR2P21452 398 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD13P35453 343 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IL9RQ01113 521 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MGAT3Q09327 533 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LMAN2Q12907 356 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM25Q86YD3 366 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MCUQ8NE86 351 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KAT5Q92993 513 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SVILO95425 2214 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 POLBP06746 335 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINF2P08697 491 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRLRP16471 622 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRPAP1P30533 357 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MATKP42679 507 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN4P51793 760 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS15P98073 1019 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ECT2LQ008S8 904 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZP2Q05996 745 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf61Q13536 156 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PEX6Q13608 980 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BOLA3Q53S33 107 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRF1Q5T601 910 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD6Q86V97 674 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OSTM1Q86WC4 334 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FIZ1Q96SL8 496 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 INPP4BO15327 924 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OAZ2O95190 189 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OXTRP30559 389 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLK7P49862 253 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RENBPP51606 427 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN5P51795 746 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A3Q01959 620 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NETO2Q8NC67 525 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA17Q96L03 361 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms