RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PARVBQ9HBI1 364 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C75A6NL08 312 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSHQ5FYA8 562 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 LPPQ93052 612 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF157Q96PX1 679 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOX2Q99424 681 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT87PA6NCN2 255 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 E9PBE3 544 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL41O60662 606 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TUSC3Q13454 348 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CES5AQ6NT32 575 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA20Q8TB22 786 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PGM2Q96G03 612 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS51Q9UID3 782 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 OPLAHO14841 1288 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHB6O15197 1021 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF862O60290 1169 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TPST1O60507 370 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNE2O96020 404 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RPN2P04844 631 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT11Q495W5 492 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NEPROQ6NW34 567 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF21BQ96EK2 531 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CASZ1Q86V15 1759 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BMM5 538 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALT4O60513 344 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNA14P01570 189 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP3P08254 477 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PLIN5Q00G26 463 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP1Q9NVV9 213 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RIPK3Q9Y572 518 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SPTLC1O15269 473 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GJB1P08034 283 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PCNAP12004 261 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3CGP48736 1102 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOX1Q15067 660 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS50Q96JG6 964 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT17Q9BSW7 474 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HAO1Q9UJM8 370 aa16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-10P10266 1014 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP4AP20648 1035 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PCID2Q5JVF3 399 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BBS12Q6ZW61 710 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOM1P52179 1685 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NR5A2O00482 541 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 VHLP40337 213 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MSRAQ9UJ68 235 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 USP12O75317 370 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGB6P18564 788 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF844Q08AG5 666 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ECM1Q16610 540 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB2Q96Q27 587 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BATF3Q9NR55 127 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MATKP42679 507 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA7Q13683 1181 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMD5Q16401 504 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms