RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 CDH22Q9UJ99 828 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 TSC2P49815 1807 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ENO4A6NNW6 628 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SPTLC1O15269 473 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 AP2A1O95782 977 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 MLH1P40692 756 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ADIGQ0VDE8 80 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ITGA9Q13797 1035 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 CCNIQ14094 377 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 METTL21CQ5VZV1 264 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 TNIP3Q96KP6 325 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 GORASP1Q9BQQ3 440 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ADCY6O43306 1168 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 USP1O94782 785 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 BAG2O95816 211 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 MPOP05164 745 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 AIF1P55008 147 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 FSCBQ5H9T9 825 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 RNF220Q5VTB9 566 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SLC30A9Q6PML9 568 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 EPGNQ6UW88 154 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 PHC3Q8NDX5 983 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 SLC9A7Q96T83 725 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 CEP41Q9BYV8 373 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 CDH19Q9H159 772 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GPR32O75388 356 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ITGAXP20702 1163 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF6Q58WW2 860 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 XKR4Q5GH76 650 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FOXB2Q5VYV0 432 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PDSS2Q86YH6 399 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CCNYQ8ND76 341 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 APPL2Q8NEU8 664 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZFAND2BQ8WV99 257 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP16Q9BY84 665 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 VCX3BQ9H321 246 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CASS4Q9NQ75 786 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HES2Q9Y543 173 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KCNE1P15382 129 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ACAD11Q709F0 780 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RAPH1Q70E73 1250 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 STON2Q8WXE9 905 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NTAN1Q96AB6 310 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SPON1Q9HCB6 807 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 G3V2L1 256 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN3P26045 913 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TAF6P49848 677 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SCAPQ12770 1279 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA3BQ13214 749 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD11Q693B1 232 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RNF111Q6ZNA4 994 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH3Q86UC2 560 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 WNT8BQ93098 351 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 BFARQ9NZS9 450 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms