RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM131BQ86XD5 332 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 APCDD1Q8J025 514 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf20Q8ND61 904 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIK2Q9H0K1 926 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM51Q9NW97 253 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDGFRAP16234 1089 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDC4P31431 198 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN9P43378 593 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREB5Q02930 508 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARTNQ5T4W7 220 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACUL1Q86Y37 369 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T3Q8NH03 318 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K13O43283 966 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTN5O94779 1100 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOCS3O95396 460 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF806P0C7X5 589 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT3P12035 628 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCIP41743 596 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGER3P43115 390 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBASH3AP57075 661 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDO1Q16878 200 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RMDN1Q96DB5 314 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTG2Q9H4K7 406 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS45Q9NRW7 570 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN11O75508 207 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7P10643 843 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFAIP3P21580 790 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUMBP49757 651 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLK1P53350 603 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH4P55283 916 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC12A1Q13621 1099 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALFQ53S48 1182 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRADAQ7RTN6 431 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM1BQ8NB78 822 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG14Q96F25 216 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf74Q96LT6 269 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQJ5 194 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRGXA6NNA5 263 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPD1P21695 349 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRM1P23921 792 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXCT1P55809 520 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC4P56524 1084 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST8SIA6P61647 398 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP8P85298 464 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECT2LQ008S8 904 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR59Q6PJI9 974 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms