RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RIMBP2O15034 1052 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 AKAP10O43572 662 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TIPRLO75663 272 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KCNH1O95259 989 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GABRB3P28472 473 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RBL1P28749 1068 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GSSP48637 474 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CDH6P55285 790 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 WNT7BP56706 349 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DPYSQ14117 519 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RAB39AQ14964 217 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CYGBQ8WWM9 190 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 APBB2Q92870 758 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC138Q96M89 665 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PAK5Q9P286 719 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ACOT8O14734 319 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 AQP9O43315 295 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GMNNO75496 209 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 VAPBO95292 243 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 BCL10O95999 233 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZACNQ401N2 412 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NEPROQ6NW34 567 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TANKQ92844 425 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC17Q96LX7 622 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 APBA2Q99767 749 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FAM159BA6NKW6 160 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SOCS2O14508 198 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PFDN6O15212 129 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TPST1O60507 370 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 VNN1O95497 513 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ERBB2P04626 1255 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 INHBBP09529 407 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 MIPP30301 263 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NEK2P51955 445 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RALGDSQ12967 914 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CARTPTQ16568 116 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SEZ6Q53EL9 994 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SMUG1Q53HV7 270 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 UTS2BQ765I0 119 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 C14orf80Q86SX3 495 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SGF29Q96ES7 293 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CDH7Q9ULB5 785 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GAKO14976 1311 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PTPRJQ12913 1337 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 WDR27A2RRH5 827 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FAM149AA5PLN7 773 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NRP1O14786 923 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CHRNGP07510 517 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CD19P15391 556 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms