RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TP73O15350 636 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 TJP3O95049 919 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 LTFP02788 710 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJB1P25685 340 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 CHKAP35790 457 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 MATKP42679 507 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN9P43378 593 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 RASSF2P50749 326 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ERVFC1P60507 584 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ACAP1Q15027 740 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 RCN1Q15293 331 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 TMC7Q7Z402 723 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 TCF25Q9BQ70 676 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF6Q58WW2 860 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 NRG4Q8WWG1 115 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PTPRN2Q92932 1015 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA17Q96L03 361 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PBX2P40425 430 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 CREMQ03060 361 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 LAMA3Q16787 3333 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PDLIM1O00151 329 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CXCL14O95715 111 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 IL1R2P27930 398 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 MIPP30301 263 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PGFP49763 221 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 POF1BQ8WVV4 589 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 TBCBQ99426 244 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 NOS2P35228 1153 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC3Q13217 504 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 MYBPC3Q14896 1274 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4X1Q8N118 509 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 GIPC2Q8TF65 315 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PEBP4Q96S96 227 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 VCX3BQ9H321 246 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC19Q9H756 370 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 IL37Q9NZH6 218 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC4P56524 1084 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC38Q5VT99 294 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 EDEM1Q92611 657 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PDP2Q9P2J9 529 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 SCML2Q9UQR0 700 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 DCTN3O75935 186 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 NCAM1P13591 858 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 SULT1E1P49888 294 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 IL9RQ01113 521 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 OCRLQ01968 901 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 SCD5Q86SK9 330 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 GATA6Q92908 595 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 NT5C3BQ969T7 300 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-201ENST00000265339 NPY6RQ99463 290 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms