RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264028.4

ARCN1-201, Transcript of archain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARCN1, Length 3,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1-201ENST00000264028 IFT88Q13099 833 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GPR17Q13304 367 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PRPSAP1Q14558 356 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 FAM136AQ96C01 138 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 APOL5Q9BWW9 433 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.37□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ANK1P16157 1881 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ALOX15BO15296 676 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ERVK-10P10266 1014 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GLUD2P49448 558 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GPX6P59796 221 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ALFQ53S48 1182 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TXNDC8Q6A555 127 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 BADQ92934 168 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CABS1Q96KC9 395 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SPG21Q9NZD8 308 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CBX4O00257 560 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CXCL14O95715 111 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CCNB1P14635 433 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 WEE1P30291 646 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PTPN7P35236 360 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 DMTNQ08495 405 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 RAB41Q5JT25 222 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 NLRP14Q86W24 1093 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 RRN3Q9NYV6 651 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CLUHO75153 1309 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 H0YHG0 523 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CCL22O00626 93 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 TLL1O43897 1013 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SEC24AO95486 1093 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PTPN3P26045 913 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CHRNA4P43681 627 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ZBTB17Q13105 803 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CROCCP2Q86T23 111 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 LRRC6Q86X45 466 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CORO1BQ9BR76 489 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 FICDQ9BVA6 458 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 MUC3BQ9H195 1237 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 VPS11Q9H270 941 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 ZFATQ9P243 1243 aa7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GMNCA6NCL1 334 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 F5H5T6 163 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 J3KR12 359 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PER2O15055 1255 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 FGBP02675 491 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CTNNB1P35222 781 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SCNN1AP37088 669 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PGGT1BP53609 377 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 NKX3-2P78367 333 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 CYP4F8P98187 520 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 HECTD3Q5T447 861 aa7.35□□□□□ -1.23
ARCN1-201ENST00000264028 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms