RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 GBA3Q9H227 469 aa20.2■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.2■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TTC3P53804 2025 aa20.2■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TNFRSF10BO14763 440 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 IRAK2O43187 625 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 IL1BP01584 269 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NEFHP12036 1026 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CRHR1P34998 444 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NAB1Q13506 487 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 KCTD11Q693B1 232 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PACS1Q6VY07 963 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DPF3Q92784 378 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NEU3Q9UQ49 428 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 POLBP06746 335 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CYP2C18P33260 490 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SP3Q02447 781 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TEX44Q53QW1 395 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 VAT1Q99536 393 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.19■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 USP12O75317 370 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DDHD2O94830 711 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TGDSO95455 350 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 GRIK1P39086 918 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 EOMESO95936 686 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 OR4Q2P0C623 313 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DSC1Q08554 894 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MBTPS1Q14703 1052 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MECRQ9BV79 373 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CASS4Q9NQ75 786 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PSAT1Q9Y617 370 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.18■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NFKB1P19838 968 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PGFP49763 221 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CES3Q6UWW8 571 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CERS2Q96G23 380 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TEKT5Q96M29 485 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SNCBQ16143 134 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SCD5Q86SK9 330 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 HAPLN3Q96S86 360 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SIK2Q9H0K1 926 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.17■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ATP5HO75947 161 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZNF33AQ06730 810 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 RASSF3Q86WH2 238 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 STKLD1Q8NE28 680 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CASP10Q92851 521 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 KCNK13Q9HB14 408 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 BFARQ9NZS9 450 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZFATQ9P243 1243 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.16■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 A0A0G2JND7 137 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ITGA2BP08514 1039 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms