RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc110Q3V125 848 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxo39Q5NBU5 443 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt32Q62168 407 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dalrd3Q6PJN8 538 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stambpl1Q76N33 436 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ric8bQ80XE1 520 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AarsQ8BGQ7 968 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Iars2Q8BIJ6 1012 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AtripQ8BMG1 785 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PisdQ8BSF4 406 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc19Q8BZT5 364 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmx4Q8C0L0 335 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asb14Q8C6Y6 587 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dclre1bQ8C7W7 541 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 KyQ8C8H8 661 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp263Q8CF60 680 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc66Q8K0B3 872 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abhd8Q8R0P8 439 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmprss4Q8VCA5 435 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rin1Q921Q7 763 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pex6Q99LC9 981 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox16Q9CR63 106 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps22Q9CXW2 359 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubqln5Q9D4I8 510 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ovca2Q9D7E3 225 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efcab9Q9DAM2 216 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rmdn1Q9DCV4 305 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt7Q9DCV7 457 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spag6Q9JLI7 507 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx1Q9WV80 522 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb6cW4VSP4 379 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dock1Q8BUR4 1865 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tox2A2A472 547 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ism1A2ATD1 454 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox3cA2AWM0 215 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13212B1ASQ7 799 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lce6aD3YV94 81 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp780bE9Q2S6 806 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smim22J3QP37 91 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox3hL7MU37 215 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ring1O35730 406 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psma3O70435 255 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rag1P15919 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elk3P41971 409 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il12aP43431 215 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Yap1P46938 488 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif4ebp2P70445 120 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Irx2P81066 474 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 InhbaQ04998 424 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem120bQ3TA38 339 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp607aQ3TQG9 686 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt26Q3TRJ4 462 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox3aQ4TU90 215 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GstcdQ5RL51 634 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spa17Q62252 149 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fnip1Q68FD7 1165 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rad9bQ6WBX7 403 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uts2bQ765I1 113 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MroQ7TNB4 248 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Far2Q7TNT2 515 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CcnyQ8BGU5 341 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ofcc1Q8BGX4 166 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl38Q8BSF5 581 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp43Q8BUM9 1132 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif2b5Q8CHW4 717 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acsl5Q8JZR0 683 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eml3Q8VC03 897 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Caap1Q8VDY9 356 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Reep3Q99KK1 254 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt20Q9D312 431 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oser1Q9D722 291 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neu2Q9JMH3 379 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts5Q9R001 930 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oaz3Q9R109 243 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp4a12bA2A974 508 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam166bA2AIP0 273 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r27D3YUK6 857 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.9 ms