RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc40Q8BI79 1192 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dpp9Q8BVG4 862 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsdmc3Q8CB12 480 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snx9Q91VH2 595 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vangl2Q91ZD4 521 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim42Q9D2H5 723 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Osbpl8B9EJ86 889 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdr1E9Q0B4 517 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21293E9Q4G9 266 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tekt5G5E8A8 557 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cbfa2t2O70374 594 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BpgmP15327 259 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Glud1P26443 558 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrkcqQ02111 707 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grm6Q5NCH9 871 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mxd4Q60948 209 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcna4Q61423 654 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sema3cQ62181 751 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2c29Q64458 490 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rimbp2Q80U40 1072 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kctd13Q8BGV7 329 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr60Q8C761 999 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmprss4Q8VCA5 435 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asah2Q9JHE3 756 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PolhQ9JJN0 694 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccr10Q9JL21 362 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nme3Q9WV85 169 aa18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trbv4A0A075B5I2 113 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm13276A0A087WR18 182 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp358E9Q8M1 571 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt10P02535 570 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gnrh1P13562 90 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc10a3P21129 473 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dpf3P58269 378 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itga4Q00651 1039 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fscn2Q32M02 492 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr293Q7TS10 336 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Man2a2Q8BRK9 1152 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ston2Q8BZ60 895 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ClmnQ8C5W0 1052 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8VDP2 222 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CabyrQ9D424 453 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il20Q9JKV9 176 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ErmapQ9JLN5 566 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rtl9Q32KG4 1339 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mkrn2osD3Z393 217 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20503G3UZK1 150 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Syngr1O55100 234 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CidebO70303 219 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01670 111 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01671 111 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01672 111 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-Eb1P04230 264 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ChgbP16014 677 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 M6prP24668 278 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atxn10P28658 475 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grb10Q60760 621 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc20a1Q61609 681 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RfflQ6ZQM0 377 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PimregQ8BFY7 231 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam204aQ8C6C7 236 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Angel1Q8VCU0 667 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LiasQ99M04 373 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gins2Q9D600 185 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il17rbQ9JIP3 499 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plod1Q9R0E2 728 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3336J3QMQ6 198 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde8aO88502 823 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc2a7P0C6A1 513 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NrlP54846 237 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psmb4P99026 264 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Capn11Q6J756 714 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dusp16Q6PCP3 660 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myoz3Q8R4E4 245 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spon1Q8VCC9 807 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snx15Q91WE1 337 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sult5a1Q91X36 291 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Noxred1Q9D3S5 366 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dlgap1Q9D415 992 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc34Q9DAM1 415 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Efcab9Q9DAM2 216 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HdcP23738 662 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms