RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Becn1O88597 448 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl6P41183 707 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc16a1P53986 493 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdr16c6Q05A13 316 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phactr4Q501J7 694 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt39Q6IFX4 482 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpm4Q6IRU2 248 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo22Q78JE5 402 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr213Q7TS32 327 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppm1lQ8BHN0 360 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpa1Q8BLA8 1125 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LssQ8BLN5 733 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IfnzQ8BQT1 182 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr20Q8BYC4 358 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13278Q8CD73 182 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhb17Q91VD8 799 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgs1Q923W1 853 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigxQ99LV7 254 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LrgukQ9D5S7 820 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl10Q9D5V2 608 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ift43Q9DA69 206 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcaf6Q9DC22 876 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc23a2Q9EPR4 648 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Copb1Q9JIF7 953 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mnx1Q9QZW9 404 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CalcrlQ9R1W5 463 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gbp2Q9Z0E6 589 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plxnb1Q8CJH3 2119 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna1aP97445 2368 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Golga4Q91VW5 2238 aa11.54□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm1993A6X8I0 212 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf518bB2RRE4 1077 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SlxD3Z347 212 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930558K02RikE0CXC6 182 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FancfE9Q5Z5 343 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdx2P43241 311 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tyro3P55144 880 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp25P57080 1055 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpm2P58774 284 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpcr1Q3TNW5 500 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC051142Q3V0M8 400 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam92bQ3V2J0 292 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q66JV7 365 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tdpoz2Q717B2 364 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8BL95 290 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sphk1Q8CI15 382 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh2d5Q8JZW5 429 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PdxkQ8K183 312 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sirt5Q8K2C6 310 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RtbdnQ8QZY4 247 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slco3a1Q8R3L5 710 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr697Q8VFM4 317 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim14Q91VT8 99 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ipo9Q91YE6 1041 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Antxr1Q9CZ52 562 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erp44Q9D1Q6 406 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cul2Q9D4H8 745 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htra2Q9JIY5 458 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jag2Q9QYE5 1247 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CorinQ9Z319 1113 aa11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fer1l5P0DM40 2038 aa11.52□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13271B1AYH9 182 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9992B2RWK3 458 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20671F6TVX7 576 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tekt5G5E8A8 557 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3488M0QW81 238 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sept7O55131 436 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Avpr2O88721 371 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FshrP35378 692 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CskP41241 450 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra9Q2TJJ8 266 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3UE31 404 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr121Q5CZY0 321 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttf2Q5NC05 1138 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acvrl1Q61288 502 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc13a5Q67BT3 572 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chsy1Q6ZQ11 800 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc93aQ710D3 458 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc17Q80TN5 632 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcas1Q80YN3 633 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C5ar2Q8BW93 344 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk13Q8CGR6 276 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf628Q8CJ78 1038 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acsl5Q8JZR0 683 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r89Q8R256 316 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc3Q91YW3 504 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa11.52□□□□□ -0.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd1Q9CR42 319 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms