RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LENG9Q96B70 501 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PIF1Q9H611 641 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 AKAP12Q02952 1782 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C5orf58C9J3I9 102 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CHADO15335 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 BAIAP3O94812 1187 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NUDT17P0C025 328 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TPBGLP0DKB5 382 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 OTULINQ96BN8 352 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MEI4A8MW99 385 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 M0R2N6 131 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GPR25O00155 361 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GRM5P41594 1212 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NAGLUP54802 743 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RETSATQ6NUM9 610 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C16orf87Q6PH81 154 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ZFP42Q96MM3 310 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CPNE1Q99829 537 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 UBDO15205 165 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 B4GALT4O60513 344 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GUCA1CO95843 209 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ERBB2P04626 1255 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NFKB1P19838 968 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NEPROQ6NW34 567 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DAW1Q8N136 415 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 VAT1Q99536 393 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 A8MX80 341 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LCA5LO95447 670 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 BRCC3P46736 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PRKAA1Q13131 559 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 VPS50Q96JG6 964 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TOMM70O94826 608 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 KRT72Q14CN4 511 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 APBB2Q92870 758 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SHISA4Q96DD7 197 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TRIM17Q9Y577 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TPP1O14773 563 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RAG1P15918 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DAB2P98082 770 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RNF208Q9H0X6 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DMAC2Q9NW81 257 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MPOP05164 745 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ADSSP30520 456 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDK16Q00536 496 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DMC1Q14565 340 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NR6A1Q15406 480 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 THAP11Q96EK4 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CNBD2Q96M20 576 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HPS4Q9NQG7 708 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM50BQ9Y247 325 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ATP6V1G2O95670 118 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MMP13P45452 471 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 JAG1P78504 1218 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NFYCQ13952 458 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC153Q494R4 210 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms