RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 DCAF16Q9NXF7 216 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 FAM30AQ9NZY2 134 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 GPR160Q9UJ42 338 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CD207Q9UJ71 328 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 COG5Q9UP83 839 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MTMR6Q9Y217 621 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CDYLQ9Y232 598 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RAD54BQ9Y620 910 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.66□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 COL15A1P39059 1388 aa2.65□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ARHGEF37A1IGU5 675 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LRRD1A4D1F6 860 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 KRT87PA6NCN2 255 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 URADA6NGE7 173 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 AGAP5A6NIR3 686 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ZNF263O14978 683 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 DCLK1O15075 740 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PRPSAP2O60256 369 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 KINO60870 393 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TOX4O94842 621 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 OR2C1O95371 312 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 FYNP06241 537 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 RB1P06400 928 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 C1SP09871 688 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 VSIG10L2P0DP72 767 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 C6P13671 934 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ACP5P13686 325 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 HGFP14210 728 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PTPN2P17706 415 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ERCC2P18074 760 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 KCNA3P22001 575 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 FGFR4P22455 802 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CPT2P23786 658 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 YY1P25490 414 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 NTSR1P30989 418 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TTKP33981 857 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 THBS4P35443 961 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CPOXP36551 454 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 BMPR1AP36894 532 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PBX3P40426 434 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SLC15A1P46059 708 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 GZMKP49863 264 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 STAT2P52630 851 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LOXL3P58215 753 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CLRN1P58418 232 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LILRA4P59901 499 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ERVFRD-1P60508 538 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 RAP2BP61225 183 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 OLR1P78380 273 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ZP2Q05996 745 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PIGFQ07326 219 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SCN1BQ07699 218 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SLFN5Q08AF3 891 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SEMA3BQ13214 749 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SLC14A1Q13336 389 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CCNIQ14094 377 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CLCA4Q14CN2 919 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 RAB3GAP1Q15042 981 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PKN1Q16512 942 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 GSTA3Q16772 222 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ANKDD1AQ495B1 522 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 RUNDC3AQ59EK9 446 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CST9LP1Q5W188 147 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ANKRD40Q6AI12 368 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 FAM111BQ6SJ93 734 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 CLEC9AQ6UXN8 241 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LINC00346Q8IVM7 164 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 OR4N4Q8N0Y3 316 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 LILRA2Q8N149 483 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 PDPRQ8NCN5 879 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 TBC1D15Q8TC07 691 aa2.65□□□□□ -1.99
ATRX-220ENST00000635865 NEK9Q8TD19 979 aa2.65□□□□□ -1.99
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