RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STOML2Q9UJZ1 356 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H0Y626 953 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRFP11831 508 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTNNA2P26232 953 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DYNLT1P63172 113 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAD2Q05329 585 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR1H3Q13133 447 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTA1Q13330 715 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDH18Q13634 790 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPYSL3Q14195 570 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPYSL2Q16555 572 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IER5LQ5T953 404 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FYB2Q5VWT5 728 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KAZNQ674X7 775 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AADACL2Q6P093 401 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RFX8Q6ZV50 586 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RFX6Q8HWS3 928 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFN1Q8IWA4 741 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALG3Q92685 438 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD101Q93033 1021 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAI1Q9UI46 699 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC66A2RUB6 948 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARNTLO00327 626 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM24O15164 1050 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMPD1P23109 780 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KDELR1P24390 212 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJA4P35212 333 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC6A11P48066 632 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RWDD2BP57060 319 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEMA3BQ13214 749 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPS6KA1Q15418 735 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MANEALQ5VSG8 457 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC38Q5VT99 294 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C1orf74Q96LT6 269 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEU3Q9UQ49 428 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1B0GVM2 712 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNK3O14649 394 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOCP08134 193 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT10P13645 584 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CXCR5P32302 372 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PFKPQ01813 784 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDK2Q15119 407 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNASE1L2Q92874 299 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HAUS1Q96CS2 278 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHFRQ96EP1 664 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HES6Q96HZ4 224 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR24Q96S15 920 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GFRA2O00451 464 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP3K6O95382 1288 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOQP17081 205 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERCC2P18074 760 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR1E1P30953 314 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DGKGP49619 791 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms