RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PKDCCQ504Y2 493 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.217e-7■■□□□ 11.5
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CAPNS1-205ENST00000588780 MFN1Q8IWA4 741 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 LSMEM2Q8N112 164 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 TMC2Q8TDI7 906 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 EDEM1Q92611 657 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 SIGLEC6O43699 453 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 WISP1O95388 367 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 ASLP04424 464 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 BACH2Q9BYV9 841 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 USP12O75317 370 aa22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC11A2P49281 568 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 ADPRHP54922 357 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 VAC14Q08AM6 782 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 PROX2Q3B8N5 592 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 TMC6Q7Z403 805 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPTLC2O15270 562 aa22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 PPP2CAP67775 309 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 STAT4Q14765 748 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB41Q5JT25 222 aa22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 CARNMT1Q8N4J0 409 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 AADATQ8N5Z0 425 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC17Q96AE7 1141 aa22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 STK40Q8N2I9 435 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO19Q96H55 970 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.59■■□□□ 1.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-205ENST00000588780 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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